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2007年5月5日土曜日

ダメ人間はゴミを捨てないの法則。そして、ゴミ収集カレンダー RSS のレビュー。

ダメ人間って、どういう人間の事をいうのでしょうか。いや、ほんとに嫌な奴って意味ではなくて、なんとなく、なんとも憎めない愛すべきダメ人間というか、まあ、そういう意味で。どうやら、そういうダメ人間の条件の一つは「ゴミを捨てずに部屋にためこむ人間」のようです。


仕事関係で僕を知っている人は、当然知っているのだと思いますが、僕は大学で教員をやって生計をたてています。ところが、この事、仕事以外の僕の知り合いの間ではあまり知られていません。いや、隠しているわけではないのです。でも、みんなあんまり信じてくれないのです。なにより、みんななんとなく、僕の風貌から、僕が安定収入のある職に就いているとは思っていないようです。いままで勘違いされていた中で一番まともだったのが「自称イラストレーター」と「自称ライター」。さすがに「イラストレーター」は違いますが、「ライター」は当たらずしも遠からずです。論文書くのが仕事ですから。

あと、なかなか卒業できなくて年とった学生だと思われてることもよくあります。「いつ卒業すんの?」と聞かれたり。学会に行ったときに「筑波大で OCT の研究なさってるんですか?じゃあ、安野先生のところの学生さんですか?」と聞かれたこともあります。その時は「あ、まあ、そんなところです」と答えておきました。

こんな風に、いろいろ言われる僕ですが、一番広く信じられているのが「安野フリーター説」です。さすがに 32 歳で一人暮らしですから、仕事はしてると思われてるようです。猫も養わないといけませんし、収入0では生きていけませんから。でも、定職に就いているとも思われていないようです。しかも、その知人たちは漠然とそう思ってるだけではなく、どうやら、信じ込んでいるのです。たぶん、そう信じ込んでる別の誰かから聞いたのでしょう。「そういや、安野君って、仕事なにしてんのかな?」「フリーターでしょ?」とか。「ああ、なるほどねー。それっぽい。それっぽい。」とか。で、真剣な顔で「安野君、もう若くないんだから、そろそろちゃんとした仕事見つけた方がいいよ」と説教されたりするのです。まあ、そう言われて「そうですねー。なんかいい仕事ないですかねー」と本気で転職を思う僕も困ったものなのですが。

どうして僕は三十二にもなって、特に根拠なく、こんな風にみんなに思い込まれているのかと、それで僕は考えてみたわけです。僕の結論は… たぶん、オーラが出てるんですね。ぷらっぷら生きてるオーラが。憎めないけど頼りにもならないオーラが。たぶんうなじのあたりから、ゆらっゆらと、中途半端に灰色とか、そういう頼りない色のオーラが。


先日、高知の友人から「お花見やるよ」と連絡をうけました。ぷらっぷらオーラ全開の僕は即答で「行きます!」と答え電車に飛び乗りました。お花見やると四国から連絡を受け、一も二もなく出かけることも安野フリーター説の原因になっているとは思うのですが、それは、まあ、いいのです。で、そのお花見に行った先の高知で、友人と帯屋町に飲みに行ったのです。で、そこで会った初対面の人と話しているうちに、こう言われました。「あれ?安野君、ひょっとしてダメ人間?」僕「あ、はい、そうです。よく言われます」「ようこそ高知へ!ダメ人間!」と。そしてその後つづけて言われたのです。「とりあえず、ゴミは捨てような」と。

(!!!)びっくりです。確かに、うちの台所にはゴミの日に捨てそびれたビールの空き缶が転がっています。一応ゴミ袋には詰めてありますが、でも、それが4袋も。ただ、そんな話、全然まったくしてないのです。ところがなんか、ばれてるのです。いや、たぶん、ばれているのではないのです。推測されたのです。「ダメ人間はゴミを捨てない」の法則なのです。たぶん、いままで僕が知らなかっただけで、世の中にはそういう真実があるのです。


それをきっかけに僕はダメ人間からの脱出を心にきめました。かなりゆるい決意ですが。で、そのための駄一歩として「ゴミは捨てよう」と決意したのです。ゴミを捨てて身も心も軽やかに、第一宇宙速度[1]を超えてダメ人間から脱出です!

ところが、襟元から灰色のオーラを出し続けている僕にはあいにくと、「ゴミを捨てる」ただこれだけのことが出来ないのです。最大の敵は、(僕にとっては)複雑怪奇なゴミ収集日程です。燃えるごみはまだしも、カンとか、ビンとか、ペットボトルとか、燃えないこいつらを、どのタイミングで出していいいのかわからんということです。「ゴミ収集カレンダー」を見ればわかるのでしょうが、そんなのまめにチェックできるぐらいならハナから灰色のオーラなんて漂わせていないのです!

そんな僕についに救世主が現れました。それが「つくば市ごみ収集カレンダー」の「RSS」です。いやあ、便利に世の中になったものです。ゴミ収集も IT 化の時代です。この RSS、自分の使ってるリーダーに登録しておけば「今日収集予定」を毎日教えてくれるわけです。夜中の12時に更新されますから、寝る前にチェックして、ゴミをまとめて、ゆっくり寝て、翌朝出勤の時にゴミを出していけます。

まだ使い始めて一週間ほどですが、我が家にたまっていたゴミ、だいぶ減りました。この調子でいけば、心も軽く第一宇宙速度を超えられる日も近いでしょう。ただ、問題は第一宇宙速度を超えただけでは、ダメ人間の周りを周回するダメ衛星にしかなれないことですが…。

ダメ人間脱出のための第二宇宙速度[2]への道のりはまだまだ遠いようです。

Joschi

[1] 第一宇宙速度:地球の大気圏から脱出するためにロケットが必要とする打ち上げ速度です。これを超えるとロケットは大気圏を脱出し、衛星軌道に乗ることができます。
[2] 第二宇宙速度:地球の重力を振り切り太陽周回軌道に乗るために必要な速度です。詳しくは、たとえばWikipedia 日本語版の記事参照。

2007年4月29日日曜日

Review: JabRef

最近はめっきり、図書館に論文をコピーしに行くことはなくなりました。いや、論文、読まなくなったわけじゃないですよ。むしろ昔より読んでます。でも、図書館に出かけて「紙のコピー」をとることって、なくなりましたね。だって、最近は、ほとんどの論文がインターネット経由で PDF でダウンロードできますから。

ある論文を読んでいて、そこで引用している別の論文が気になったら、すぐにネットでダウンロード。論文読む数も増えますし、手持ちの PDF の数も増えていきます。一本の論文から複数の参考文献を引いて、さらにその参考文献から孫引きしていくわけですから、文字通りネズミ算的に増えるわけです。

で、その結果どうなるのかというと…

一、 デスクトップが PDF でいっぱいになる。
二、 しょうがないので一つのフォルダにまとめる。
三、 でも、結局数が多すぎてほしい時にほしい論文が手に入らない。
四、 しょうがないので、またジャーナルのサイトから同じ論文をダウンロードする。
五、 すると今度は、単に無意味に PDF の数が増える
六、 PDF の数が増えたのでさらに論文は見つからなくなる。

まさに六道輪廻。無間道です。そんな僕をニルヴァーナ(涅槃)に導いてくれたのが JabRef でした。

JabRef は GPL というライセンスの下で配布されている Java ベースの文献管理フリーソフトです。論文のタイトル、著者、ジャーナル、ページなどをデータベースとして保存・管理してくれます。また、データベースそのものはは LaTeX という(多くの技術屋が愛して止まない)組版システムで用いられる bibTeX 形式になっています。ですから、あなたが LaTeX で論文を書いているのであれば、各文献につけたタグを自分の原稿に書き込むだけでそのまま参考文献として引用できます。

この JabRef、この手のフリーソフトの常として「開発者=ヘビーユーザー」です。ですから、ユーザーのかゆい所に手が届くようにどんどん改良されていくわけです。どの辺に手が届いているのかというと…

まず、単純な検索式を組み合わせることで、大量の論文の中から素早くほしい論文がみつけられます。さらに、文献と PDF を関連付けることが出来ます。つまり、検索でほしい文献をみつけて、その脇の PDF アイコンをクリックするだけでその文献の PDF ファイルが閲覧できるわけです。(ちなみに、この機能、PDF だけでなく、Word や PowerPoint など、どんなファイル形式に対しても使えるようです。)また、文献とURLを関連付けることもできますから、Optics Express みたいにマルチメディアファイルのついてくるジャーナルは、マルチメディアファイルをURLを登録しておけばすぐにそのファイルのダウンロードページを開くこともできます。

また、論文情報の登録自体がめんどくさい!という人は CiteSeer や PubMed などのデータベースから文献情報をインポートすることもできます。(Web of science からインポートできないのは玉に傷ですが…)

そして、なによりも使いやすいのが文献のグルーピングです。各文献を「グループ」に登録することができるのす。たとえば「××論文の参考文献」というグループを作ってそこに××という論文で引用されていた参考文献をすべて登録しておくことができます。で、実際に××を読んでいるときにサクサク引いて内容を確認できるわけです。また、グループは、「フォルダ分け」とは違ってひとつの文献をいくつものグループに登録することができます。ですから、「この文献はどっちのグループに入るの?」と悩む必要はありません。両方に登録すればいいのです。さらに、このグループ化は動的に行うこともできます。例えば「タイトルに OCT とついてる論文」という動的グループを作っておくと、自分でわざわざグループに登録しなくても「タイトルに OCT とついてる論文」は自動的にそのグループに登録されるのです。

僕自身最近では、この JabRef、すでに文献管理を超えた使い方をしています。例えば、自分や同僚が投稿中の論文も登録しています。これをしとけば、外の人間と議論をしているときに、すぐに「未発表」の資料をとりだすことができます。未発表の資料は当然ながらネットで落としてくるわけにいきませんから、これが非常に便利なのです。

また、僕自身が現在レビュアーとして在査読している論文も登録しています。この時、文献情報に peerreview というキーワードを追加しておきます。そして、そのキーワードをもった論文は自動的に「査読中」という動的グループに登録されるにようにしています。

さらに最近では、プロジェクトの資料もこれで集積しています。関連文献はもとより、内部資料(PDF だけでなく、Word や PowerPointなど)、関連したデバイスのカタログ、そのメーカーのURLなんかも「文献」として登録します。で、それを「~プロジェクト」というようなグループに登録してしまうわけです。必要であれば、関連メールなんかもファイルとして保存して、JabRef に登録してしまいます。そのプロジェクトに関する資料は参考文献からスタッフとのやりとりメールにいたるまで、すべて JabRef から閲覧、検索できるわけです。

たぶん、同様のことができるソフトは他にもいろいろあるんだと思います。でも、JabRef はオープンソースでフリーです。さらに、他の大規模なソフトに比べて、コンパクトで単純なソフトです。

僕は、単純なものを色んなふうに工夫して使うのが、面白いなあ、と、思います。

Joschi

2007年3月27日火曜日

Review: livedoor Reader

COG の山成君にすすめられて、livedoor Reader (RSSリーダー) を使いだしました(山成君のブログ)。いやはや、便利ですね、これ。今までは FireFox 組み込みの RSS リーダーと WWWC というページ更新チェッカを使っていて、まあ、それなりに満足してました。でも、 livedoor Reader を使い出した今となっては、もう、あの頃にはもどれません。

土曜の昼間には、隣町土浦のドトールの隅っこの席で、おっちゃん・おばちゃんの煙草の煙にまかれながらコツコツ未読記事のチェックをしています。一週間たまった論文誌の記事の要約をチェックをしてると、なんとなく仕事してるような充実した気分ります。まあ、気分だけなんですが。論文自体を読んでるわけではないですから。でも、そのおかげで、週末の夜は安心した気分で泥酔できますし、日曜日は安心して昼まで寝てられます。まあ、目が覚めた後、「このままじゃ俺、ダメになる」と思ったりもするのですが。

話をもどしましょう。この livedoor Reader、更新のチェックから、記事のサマリまで、統一したインタフェースで扱えるというのが便利です。便利なのですが、それに加えて、いや、それ以上にショートカットキーがいい味出してます。便利とか、そういう合理的な話だけではなく、「いい味」だしてるのです。「j」で次の記事、「k」で前の記事。ああ、ぁぁあああ。まるでインターネット黎明期の(テキストベースの)ニュースリーダーのようではないですか。

学生時代、授業が終わると情報処理センターの端末室に直行し、夜10時の閉館時間まで、モノクロCRTのX端末にかじりついて、ニュースグループに目を通したり、UNIXの設定ファイルいじったりしていた頃の記憶が蘇ります。

大学 2 年の秋のことです。情報系の先輩に「www ってのができて、世界中のいろんな機関が公開している画像や情報がたちどころに手に入る」というのを教えてもらいました。そして、早速、StarTreck Next Generations のファンサイトを訪れました。感激しました。それから早くも 13 年。NASA の Gopher[*1] サイトの英語記事を辞書を引き引き読んでいたころから14年です。あの頃も「このままじゃ、俺、ダメになる」と思っていました。

あれ?10年以上たっているわりには、技術も僕も、そんな成長してないような…。まあ、まだ、「ダメに『なった』」わけではないのでよしとしましょう。

Joschi

[*1] 若い衆はしらんと思いますが、テキストベースの www みたいなもんです。参考 [Wikipedia:Gopher]

2007年3月21日水曜日

Paper Review #1: 1 um OCT と高分解能

A.D. Aguirre, P.R. Herz, Y. Chen, J.G. Fujimoto, W. Piyawattanametha, L. Fan and M.C., "WuTwo-axis MEMS Scanning Catheter for Ultrahigh Resolution Three-dimensional and En Face Imaging," Optics Express 15, 2445-2453 (2007) [Link to the article].

ちょっと前の Optics Express に掲載されていた MIT の OCT グループによる論文です。タイトルからもわかるとおり、主題は MEMS ミラーを使った OCT 用小型高速カテーテルスキャナーです。この主題に関しては、論文を読めばいいことなので、それ以外の読んでて少し気になったことについて書こうと思います。

一般的にカテーテル OCT では 1.3 um 帯の光がプローブとして用いられます。ところが、この論文で使っているOCTの光源(Nd:glass レーザー)は中心波長 1.06 um なのです。この 1 um 付近という波長帯、最近、眼底の OCT で注目を集めている波長帯です。この波長の光は硝子体(眼球の中身)の吸収の影響が小さいうえに、従来眼底のOCTで使われていた 830 nm よりも波長が長いので眼底の奥まで侵達・画像化できるんです。でも、この論文の主題はカテーテル。食道や血管が計測対象になるわけです。眼底用ではないんですね。ではどうして 1.06 um という波長帯を使っているのでしょうか?

これ、多分、(タイトルにもありますが)高分解能化のためだと思います。OCT では2種類の分解能を考える必要があります。一つは深さ方向の分解能。この分解能は「光源の波長幅に比例して高くなる」という性質があります。この論文で使われている Nd:glass レーザーは 200 nm 以上の波長幅がありますから、まず、この点で高分解能化が狙えます。さらに、この分解能は「光源の中心波長の二乗に比例して悪くなる」という特性もあります。つまり、一般的なカテーテル波長である 1.3 um よりも波長の短い 1 um 帯域はそれだけで深さ方向の分解能向上に貢献しているのです。しかも二乗で!

OCTのもう一つの分解能は横方向の分解能です。これは「プローブビーム幅に比例してよくなり、波長に比例して悪くなる」という特性があります。カテーテルの場合、カテーテル自体を小さくする必要があるため、プローブのビーム幅を大きくして横分解能を稼ぐ方法には限界があります。そこで、1.3 um よりも波長の短い 1 um 帯の光使うことで横分解能を 1.3 倍改善できるわけです。

ここで、「波長を短くすれば分解能が上がるならば、より短い 830 nm 帯域を使えばいいのでは?」という考えもできます。でも、830 nm まで短くなると今度は生体組織による散乱が強くなりすぎて組織の奥まで見えないのです。そういう意味で、1 um は高分解能が得られ、かつ、奥まで見える波長帯であるということが言えます。

さらに言えば、1 um 付近は生体を構成する主要要素の一つである水のゼロ分散領域ですから、1 um 帯域のOCTは分散による解像度の低下も受けにくくなります。このあたりも、高分解能を狙う上で有利に働くことになります。

ここまで、高分解能を狙うことが当然のよりに議論してきましたが、では、どうして高分解能を狙う必要があるのでしょうか?これは、カテーテルOCTの重要な応用が消化器系の癌検出にあるからだと思います。癌化した細胞では細胞核が肥大し、その形もいびつになることが知られています。つまり、OCTが高分解になり、細胞核まで見えるようになれば、生検をとらずに癌検査が行えるわけです。

今日はOCT光源の波長からここまで妄想をふくらませてみました。あくまでも安野の私見ですので、話半分できいておいてください。

Joschi

2007年2月26日月曜日

Review: CCleaner

最近、どうもPCの起動が重いのです。結構がんばってダイエットもしました。普段使わないデータをDVDにやいたり、デフラグかけたり。でも、やっぱり重いままなのです。

そんな中、日経PC21に CCleaner というフリーソフトが紹介されていました。PCの中の不要ファイル(一時ファイル、キャッシュの類)と不要のレジストリエントリを掃除するソフトです。インストールから掃除まで、5分程度で完了。これだけの事で、起動時間が1/3ぐらいになりました。衝撃です。

これでもう不要レジストリは怖くありません。これからはゴミを気にせずいろんなソフトをインストールしたりアンインストールしたりできます。後はリバウンドが来ないのを祈るのみ…